ישנם מספר מוסדות להשכלה גבוהה הממוקמת ברחבי פורטו ריקו, עם אוניברסיטת פורטו ריקו להיות גדול והוותיקה ביותר. כטריטוריה של ארצות הברית, ייתכן שיש לי אזרחי גישה להזדמנויות נוספות לחינוך.

ללימודי תואר שני הוא תואר ממוקד הדורש כשנתיים של עבודה לכיתה, מחקר, ואולי נייר התזה להרוויח. תכנית מתקדמת זו של מחקר מאפשרת לסטודנטים להתמחות לימודיהם נוספים באזור שמעניין אותם.